Παρά το γεγονός ότι ο Πάπας Φράγκης έχει πολύ ευεργετική επίδραση στην Καθολική Εκκλησία, στην ιστορία της υπήρχαν όχι μόνο λευκές, αλλά και μαύρες ρίγες. Εδώ είναι τα κορυφαία δέκα σκάνδαλα που ξέσπασε στο Βατικανό, που κυμαίνονται από μυστικά υλικά μέχρι τη δίκη ενός νεκρού σώματος.
- Ο Ιωάννης ΧΙΙ εξελέγη κληρονόμος στην Αγία Έδρα στην ηλικία των 18 ετών. Σύντομα το όνομά του βυθίστηκε σε ολόκληρο τον κόσμο: ο νέος ποντιακός πολίτης, πολλές φορές, προσέλκυσε την προσοχή του κοινού λόγω της προσωπικής του ζωής, την οποία ενδιαφέρεται πολύ περισσότερο από τις υποθέσεις της εκκλησίας. Ο κατάλογος των κατηγοριών που ασκήθηκαν εναντίον του Ιωάννη περιελάμβανε μια ρήτρα που έδειχνε ότι ο νέος Πάπας κάλεσε τους δαίμονες, σκότωσε και βασάνισε τους ανθρώπους και συχνά έπαιζε τυχερά παιχνίδια. Κάποιοι ιστορικοί ισχυρίζονται ότι ο Ιωάννης ΧΙΙ είχε πολλές περιπλοκές με παντρεμένες κυρίες. Ο παπισμός του τελείωσε το 964, όταν πέθανε από καρδιακή προσβολή, φέρεται να περνούσε χρόνο με μια από τις ερωμένες του.
- Φαίνεται ότι το 1470, ο Πάπας Σίξτος IV "ωριμάζει" παντού. Είχε έξι παράνομα παιδιά, ένας από τους οποίους γεννήθηκε ως αποτέλεσμα της σχέσης του με την αδελφή του. Αξίζει να σημειωθεί ότι ο ποντίφης είχε τις δικές του αρχές. Έφερε στην εκκλησία πολλά χρήματα με τη συλλογή φόρων από τις πόρνες. Επιπλέον, Ο Sixtus IV διέταξε ιερείς να πληρώσουν χρήματα για το δικαίωμα να έχουν ερωμένες. Ωστόσο, ο Πάπας μπόρεσε να γράψει το όνομά του στην ιστορία όχι μόνο εξαιτίας της ταραχώδους προσωπικής ζωής του: το παρεκκλήσι της Σιστίνας (Cappella Sistina) πήρε το όνομά του.
- Στο βιβλίο του, ο Πάπας Στέφανος VI έγραψε ότι η εκδίκηση είναι ιδιαίτερα γλυκιά μετά το θάνατο. Ίσως αυτός είναι ο λόγος για τον οποίο ζήτησε να εκταφεί το σώμα του προκατόχου του, Πάπα Φορμόζα, για να τον στείλει στο δικαστήριο. Το σώμα του αποβιώσαντος ποντίφτη κρίθηκε ένοχος πολλών εγκλημάτων, συμπεριλαμβανομένης της συνήθειάς του να εισαγάγει τον εαυτό του ως αρχιεπίσκοπος μετά την απομάκρυνσή του από αυτήν την αξιοπρέπεια. Ωστόσο, ο Πάπας Στέφανος μετά από την πράξη αντιμετώπισε επίσης μια δύσκολη μοίρα: συνελήφθη και ρίχτηκε στη φυλακή, όπου πέθανε το 897.
- Παρά τη σκανδαλώδη διαρροή μυστικών εγγράφων της Καθολικής Εκκλησίας το 2012, για πρώτη φορά τα μυστικά αρχεία του Βατικανού έπεσαν στα χέρια του κοινού το 1869, όταν η γερμανική δημοσίευση δημοσίευσε τις διαπραγματεύσεις του Πάπα Πίου IX με αξιωματούχους, όπου συζήτησε την επίδραση του ορθολογισμού, του φιλελευθερισμού και του υλισμού.
- Ένα από τα μεγαλύτερα σκάνδαλα ξέσπασε στο Βατικανό το 2010, ρίχνοντας μια σκιά στην εποχή του παπισμού του Βενέδικτου του XVI. Πριν από τέσσερα χρόνια, οι δημοσιογράφοι έμαθαν ότι ο βοηθός του Πάπα, ο Angelo Balducci και ο Chinedu Thomas Ehiem, μέλος της χορωδίας του καθεδρικού ναού του Αγίου Πέτρου συμμετείχαν στο σχέδιο για την ανδρική πορνεία. Η αστυνομία καθιέρωσε την εμπλοκή της Balducci σε αυτή την περίπτωση όταν παρέσυρε τον Eichem, ο οποίος συμμετείχε στην άμεση παράδοση των νέων στον υπάλληλο. Αυτή τη στιγμή, οι ερευνητές είναι σίγουροι ότι συνολικά ο χορωδός παρέδωσε το Baldui με τουλάχιστον 10 συναντήσεις με τους νέους, συμπεριλαμβανομένου ενός μοντέλου και ενός παίκτη ράγκμπι.
- Στις αρχές του 2013, το Βατικανό αντιμετώπισε σοβαρά οικονομικά προβλήματα όταν η Κεντρική Τράπεζα της Ιταλίας σταμάτησε να εξυπηρετεί ΑΤΜ στο Βατικανό λόγω της αδυναμίας των αρχών να συμμορφωθούν με όλους τους κανόνες που αποσκοπούν στην πρόληψη νομιμοποίηση εσόδων από παράνομες δραστηριότητες. Η αδυναμία χρήσης πλαστικών καρτών κοστίζει το Βατικανό περίπου 3 χιλιάδες ευρώ την ημέρα μέχρι τις 12 Φεβρουαρίου, όταν η ελβετική τράπεζα συμφώνησε να εξασφαλίσει τη σταθερή λειτουργία των αδρανών ΑΤΜ.
- Στις 28 Ιουνίου 2013, ο Nunzio Sczrano, ο πρώην επικεφαλής της λογιστικής υπηρεσίας, συνελήφθη μαζί με τους δύο συνεργούς του, πρώην κατασκοπεία και χρηματοδότη. Παρουσιάστηκε τα τέλη λαθρεμπορίου 20 εκατομμυρίων ευρώπου έφερε σε ιδιωτικό αεροσκάφος. Αργότερα, ο δικηγόρος του υπαλλήλου εξήγησε ότι ο θάνατός του αρνείται να παραδεχθεί την ενοχή του. Αυτό το σκάνδαλο ανάγκασαν την παραίτηση του προέδρου της Τράπεζας του Βατικανού, καθώς και του αναπληρωτή του.
- Στις 19 Ιουλίου 1982, το σώμα του Roberto Calvi, γνωστό και ως "τραπεζίτης του Θεού", βρέθηκε στη Γέφυρα του Blackfriars. Πρόεδρος της Τράπεζας του Μιλάνου Ambrosiano (στην οποία το Βατικανό είναι ο κύριος μέτοχος) κατηγορούνται για παράνομη εξαγωγή ιδιαίτερα μεγάλων ποσών στο εξωτερικό. Ο άνδρας πέταξε στο Λονδίνο, όπου σκοτώθηκε, και εκείνη την εποχή ο Αμερικανός αρχιεπίσκοπος, ο οποίος συμμετείχε επίσης στην υπόθεση Calvi, έλαβε ασυλία.
- Καθολικός κληρικός που κατηγορείται για παιδεραστία, συνελήφθη για δυσφήμηση αφού δήλωσε ότι η γκέι πορνεία ευδοκιμεί στο Βατικανό. Ο Patricio Poggi κρατήθηκε αφού οι ανακριτές υποψιάζονταν ψέμα στις δηλώσεις του. Ο Podgy ισχυρίστηκε προηγουμένως ότι ο πρώην αστυνομικός ήταν υπεύθυνος για την αναζήτηση ομοφυλόφιλων.
- Στις 23 Μαΐου 2012, το "δεξί χέρι" του Πάπα Βενέδικτου, Paolo Gabriele, συνελήφθη για τη διαβίβαση εμπιστευτικών εγγράφων του Βατικανού στον Ιταλό δημοσιογράφο Gianluigi Nuzzi. Άρχισε αμέσως να αποκαλύψει την ύπαρξη διαφθοράς εντός των τειχών του Βατικανούκαι ο Gabriele τιμωρήθηκε για κλοπή. Τον Οκτώβριο του 2012, καταδικάστηκε σε 18 μήνες κατ 'οίκον περιορισμό.